生殖器长水疱不一定是生殖器疱疹，需要去医院进行相关检查，这样才能够了解具体原因，然后根据不同原因采取不同的方式进行治疗。

生殖器疱疹属于一种病毒性疾病，主要是在身体免疫力低下，或没有注意个人卫生的情况下感染，尤其是在受到单纯疱疹病毒感染之后，会导致生殖器上面出现长疱疹。但是在出现了梅毒或艾滋病之后，也会导致局部长疱疹，所以不能够单纯通过症状来确诊是生殖器疱疹，需要去医院进行抽血化验和医生面诊才能够了解具体情况。平时要注意局部的清洁卫生，每天晚上睡觉之前需要用水清洗，能够避免出现炎症性疾病。