胃肠道缺少益生菌可能会导致消化问题、免疫功能下降、肠道菌群失衡等危害。具体分析如下：

1、消化问题：益生菌有助于维持正常的消化功能，可以帮助消化食物，如果缺少益生菌可能会影响消化，引起不适症状。

2、免疫功能下降：益生菌对免疫系统的调节起着重要作用，当体内益生菌减少，可能会导致免疫功能下降，容易遭受病原体的感染，不利于身体健康。

3、肠道菌群失衡：胃肠道中的益生菌与其他微生物共同组成肠道菌群。当益生菌减少，可能会引起肠道菌群失衡，此时有害菌可能会过度生长，导致肠道微生态紊乱。

除以上常见危害外，还可能有其他危害，比如营养吸收不良、便秘、胃肠道不适等，患者症状严重时要及时就医治疗，在医生指导下补充益生菌，有利于身体健康。